Chính Sách Ưu Đãi Đầu Tư & Miễn Giảm Thuế Trong Khu Công Nghiệp, Cụm Công Nghiệp Mới Nhất

Đặt nhà máy trong khu công nghiệp, cụm công nghiệp không chỉ giúp doanh nghiệp có hạ tầng sẵn sàng mà còn mở ra nhiều ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế nhập khẩu và tiền thuê đất. Bài viết tổng hợp các nhóm ưu đãi chính theo khung pháp luật hiện hành và cách doanh nghiệp xác định mình được hưởng ưu đãi nào.

Khung pháp lý về ưu đãi đầu tư

• Luật Đầu tư 2020: quy định khu công nghiệp là địa bàn ưu đãi đầu tư, cùng các hình thức ưu đãi (thuế TNDN, thuế nhập khẩu, tiền thuê đất, khấu hao nhanh…).
• Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2025 (số 67/2025/QH15) và Nghị định 320/2025/NĐ-CP hướng dẫn: quy định thuế suất ưu đãi, thời gian miễn, giảm thuế.
• Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2016 và các nghị định hướng dẫn: miễn thuế nhập khẩu hàng hóa tạo tài sản cố định.
• Luật Đất đai 2024 và Nghị định 103/2024/NĐ-CP: miễn, giảm tiền thuê đất.

1. Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp

Thuế suất phổ thông hiện là 20%. Đối với dự án đầu tư mới thực hiện tại khu công nghiệp, nguyên tắc ưu đãi phổ biến là:

• Miễn thuế 2 năm, giảm 50% số thuế phải nộp trong 4 năm tiếp theo, áp dụng với KCN không nằm tại địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội thuận lợi (theo danh mục địa bàn quy định tại văn bản hướng dẫn).
• Dự án thuộc ngành, nghề đặc biệt ưu đãi (công nghệ cao, công nghiệp hỗ trợ ưu tiên, sản xuất vật liệu mới…) hoặc quy mô vốn lớn có thể được hưởng thuế suất 10% trong 15 năm và thời gian miễn giảm dài hơn (đến 4 năm miễn, 9 năm giảm 50%).
• Thời gian miễn thuế, giảm thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế; nếu 3 năm đầu chưa có thu nhập thì tính từ năm thứ tư.

Lưu ý: mức ưu đãi cụ thể phụ thuộc vào ngành nghề, địa bàn và điều kiện của từng dự án. Doanh nghiệp cần đối chiếu trực tiếp Luật Thuế TNDN 2025, Nghị định 320/2025/NĐ-CP và tham vấn cơ quan thuế hoặc đơn vị tư vấn trước khi lập kế hoạch tài chính.

2. Miễn thuế nhập khẩu

• Hàng hóa nhập khẩu để tạo tài sản cố định của dự án thuộc ngành nghề, địa bàn ưu đãi đầu tư: máy móc, thiết bị, linh kiện, phương tiện vận tải chuyên dùng, vật tư xây dựng trong nước chưa sản xuất được.
• Nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu để sản xuất hàng xuất khẩu được miễn thuế theo quy định.
• Doanh nghiệp chế xuất (EPE) trong KCN được áp dụng chế độ khu phi thuế quan với hàng hóa xuất nhập khẩu.

Doanh nghiệp chế xuất (EPE): thuế GTGT và hải quan

Doanh nghiệp chế xuất là doanh nghiệp hoạt động chế xuất trong khu chế xuất, khu công nghiệp hoặc khu kinh tế (Nghị định 35/2022/NĐ-CP). Khu vực của doanh nghiệp chế xuất là khu phi thuế quan, được ngăn cách với bên ngoài và chịu sự kiểm tra, giám sát của cơ quan hải quan.

• Hàng hóa mua bán giữa nước ngoài và khu phi thuế quan: không thuộc đối tượng chịu thuế GTGT (khoản 20 Điều 5 Luật Thuế GTGT 2024).
• Hàng hóa từ nội địa bán vào khu phi thuế quan, tiêu dùng trong khu để phục vụ trực tiếp sản xuất xuất khẩu: áp dụng thuế suất 0% (khoản 1 Điều 9 Luật Thuế GTGT 2024). Bên bán cần có hợp đồng, tờ khai hải quan và chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt theo quy định; thiếu tờ khai hải quan thì không được áp dụng 0%.
• Thuế nhập khẩu: máy móc, thiết bị tạo tài sản cố định và nguyên liệu, vật tư để sản xuất hàng xuất khẩu được miễn thuế theo quy định về thuế xuất khẩu, nhập khẩu.

3. Miễn, giảm tiền thuê đất

Dự án thuộc lĩnh vực, địa bàn ưu đãi được miễn tiền thuê đất trong thời gian xây dựng cơ bản (tối đa theo quy định) và miễn thêm một số năm sau thời gian xây dựng, tùy mức độ ưu đãi. Lưu ý: khi thuê lại đất của chủ đầu tư hạ tầng KCN, ưu đãi tiền thuê đất thường áp dụng ở cấp chủ đầu tư hạ tầng; doanh nghiệp thứ cấp nên làm rõ việc chia sẻ ưu đãi trong hợp đồng thuê lại.

4. Ưu đãi riêng tại cụm công nghiệp

Cụm công nghiệp (thường dưới 75 ha, do địa phương quản lý) cũng được hưởng ưu đãi theo địa bàn và ngành nghề. Ngoài ra, nhiều tỉnh có chính sách hỗ trợ riêng như hỗ trợ đầu tư hạ tầng, đào tạo lao động, xúc tiến thương mại cho doanh nghiệp nhỏ và vừa, doanh nghiệp làng nghề di dời vào cụm.

Lưu ý thuế tối thiểu toàn cầu

Theo Nghị quyết 107/2023/QH15, doanh nghiệp thuộc tập đoàn đa quốc gia có doanh thu hợp nhất từ 750 triệu EUR trở lên (trong ít nhất 2 của 4 năm gần nhất) có thể phải nộp thuế bổ sung để thuế suất thực tế đạt tối thiểu 15%. Với nhóm này, ưu đãi thuế TNDN thấp hơn 15% có thể không còn tác dụng như trước; doanh nghiệp nên tính lại hiệu quả ưu đãi cùng đơn vị tư vấn thuế.

Làm thế nào để được hưởng ưu đãi?

1. Ghi rõ ưu đãi trong Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư hoặc quyết định chủ trương đầu tư (nếu có).
2. Doanh nghiệp tự xác định ưu đãi thuế TNDN khi quyết toán và kê khai theo mẫu phụ lục quy định.
3. Đăng ký danh mục hàng hóa miễn thuế nhập khẩu với cơ quan hải quan trước khi nhập khẩu.
4. Thực hiện đúng chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ và đáp ứng điều kiện về vốn, tiến độ giải ngân đã cam kết.

Về thời gian: với dự án không thuộc diện chấp thuận chủ trương đầu tư, cơ quan đăng ký đầu tư (Ban Quản lý các KCN đối với dự án trong KCN) cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư trong 15 ngày kể từ khi nhận đủ hồ sơ hợp lệ (Luật Đầu tư 2020). Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp được cấp trong 3 ngày làm việc (Luật Doanh nghiệp 2020).

Ví dụ minh họa

Một doanh nghiệp sản xuất linh kiện điện tử đầu tư nhà máy mới trong KCN tại Thái Nguyên hoặc Phú Thọ, năm đầu có lãi 10 tỷ đồng. Nếu thuộc diện miễn 2 năm, giảm 50% trong 4 năm: hai năm đầu không phải nộp thuế TNDN; bốn năm tiếp theo chỉ nộp khoảng 10%, thay vì 20% thu nhập chịu thuế. Đây là khoản tiết kiệm đáng kể giúp doanh nghiệp tái đầu tư mở rộng sản xuất.

Tham khảo các khu, cụm công nghiệp tại miền Bắc: Cụm công nghiệp Lương Phú – Tân Đức, KCN Tam Dương I – Khu vực 2, KCN Phúc Yên, KCN Nam Bình Xuyên Green Park.

Cẩm nang liên quan

• Thuê đất khu công nghiệp: thủ tục, hợp đồng, đặt cọc, thời hạn
• Cẩm nang thuê nhà xưởng, nhà kho xây sẵn
• Môi trường (ĐTM, GPMT), PCCC & giấy phép trong KCN
• So sánh 4 khu công nghiệp Vĩnh Phúc cũ (nay thuộc Phú Thọ)